一級結(jié)構(gòu)的表征檢測
在生物醫(yī)藥、生物化學(xué)及分子生物學(xué)領(lǐng)域,精準(zhǔn)表征生物大分子(特別是蛋白質(zhì)和多肽)的一級結(jié)構(gòu)至關(guān)重要。一級結(jié)構(gòu)是指其基本組成單元(氨基酸)通過肽鍵連接形成的線性序列,它直接決定了分子的高級結(jié)構(gòu)、生物活性、穩(wěn)定性以及免疫原性等關(guān)鍵屬性。對一級結(jié)構(gòu)的全面、準(zhǔn)確表征是藥物研發(fā)(如治療性蛋白、單抗、多肽類藥物)、生物制品質(zhì)量控制、基礎(chǔ)研究以及產(chǎn)品一致性評價的核心環(huán)節(jié)。它不僅是理解分子功能的基礎(chǔ),更是確保藥物安全性和有效性的基石。通過一系列精密的檢測項目,結(jié)合先進(jìn)的儀器和標(biāo)準(zhǔn)化的方法,科學(xué)家們能夠精確地解析出目標(biāo)分子的氨基酸組成、排列順序以及翻譯后修飾(如二硫鍵定位、糖基化位點(diǎn))等核心信息。
檢測項目
一級結(jié)構(gòu)表征通常包含以下幾個關(guān)鍵檢測項目:
- 分子量測定: 精確測定完整分子或酶解肽段的分子量,是確認(rèn)序列完整性和發(fā)現(xiàn)潛在修飾的第一步。
- 氨基酸組成分析: 通過酸水解將蛋白質(zhì)/多肽裂解為單個氨基酸,定量分析各氨基酸的種類和含量,與理論值對比以驗證序列。
- N-末端序列分析: 確定蛋白質(zhì)或多肽鏈起始端的氨基酸序列(通常前10-15個殘基)。
- C-末端序列分析: 確定蛋白質(zhì)或多肽鏈末端的氨基酸序列。
- 肽圖分析: 使用特異性蛋白酶(如胰蛋白酶)將蛋白質(zhì)酶解成肽段混合物,分離并鑒定這些肽段,用于確認(rèn)一級結(jié)構(gòu)完整性、發(fā)現(xiàn)點(diǎn)突變、降解產(chǎn)物或翻譯后修飾。
- 完整序列確認(rèn): 通過結(jié)合肽圖、串聯(lián)質(zhì)譜等手段,對目標(biāo)分子的全部氨基酸序列進(jìn)行確認(rèn)。
- 二硫鍵定位: 確定半胱氨酸殘基之間形成的二硫鍵連接方式。
- 游離巰基分析: 測定分子中未形成二硫鍵的自由巰基數(shù)量。
檢測儀器
一級結(jié)構(gòu)表征高度依賴先進(jìn)的儀器平臺:
- 質(zhì)譜儀 (Mass Spectrometry, MS): 是現(xiàn)代一級結(jié)構(gòu)表征的絕對核心。
- 基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜 (MALDI-TOF MS): 常用于完整分子量測定和肽圖分析中的肽段質(zhì)譜指紋圖譜鑒定。
- 電噴霧電離質(zhì)譜 (ESI-MS): 適用于完整分子量測定(提供高分辨率和多電荷狀態(tài)信息)、肽圖分析。
- 串聯(lián)質(zhì)譜 (Tandem MS, MS/MS 或 MS?): 通常聯(lián)用液相色譜(LC-MS/MS),是肽段序列從頭測序、翻譯后修飾鑒定和二硫鍵定位的關(guān)鍵工具(如Q-TOF, Orbitrap, Triple Quadrupole質(zhì)譜儀)。
- 氨基酸分析儀: 專門用于高靈敏度、高精度的氨基酸組成分析。
- 高效液相色譜 (HPLC):
- 反相高效液相色譜 (RP-HPLC): 是肽圖分析和純化肽段的主要分離技術(shù)。
- 離子交換色譜 (IEX-HPLC): 可用于電荷異質(zhì)性分析(部分反映序列變化)。
- 毛細(xì)管電泳 (CE): 可用于肽圖分析和純度評估,有時用于分離蛋白變體。
- Edman 降解測序儀: 經(jīng)典的N-末端序列分析方法,雖然逐漸被質(zhì)譜取代,但在特定應(yīng)用(如驗證質(zhì)譜結(jié)果、處理復(fù)雜樣本)中仍有價值。
檢測方法
不同的檢測項目對應(yīng)不同的檢測方法:
- 分子量測定: 主要使用質(zhì)譜法(ESI-MS, MALDI-TOF MS),通過去卷積軟件處理多電荷峰得到精確分子量。
- 氨基酸組成分析: 采用酸水解(通常用6N HCl,110°C,24小時)后,使用氨基酸分析儀進(jìn)行柱后衍生(如茚三酮、鄰苯二甲醛)或柱前衍生分離檢測,或利用LC-MS/MS直接分析水解液。
- N-末端序列分析:
- Edman 降解法: 逐步化學(xué)降解N-末端氨基酸并鑒定。
- 質(zhì)譜法: 通過分析完整蛋白的頂端碎片(Top-down MS)或酶解產(chǎn)生的N-末端肽段(Bottom-up MS)來推斷N-末端序列和修飾。
- C-末端序列分析: 方法相對復(fù)雜,可采用化學(xué)法(如羧肽酶酶解后分析釋放的氨基酸)、質(zhì)譜法(如電子轉(zhuǎn)移解離ETD或高能碰撞解離HCD產(chǎn)生的C-端離子)或?qū)S迷噭┖小?/li>
- 肽圖分析:
- 酶解:選擇特異性蛋白酶(常用胰蛋白酶,切割精氨酸Arg和賴氨酸Lys之后)。
- 分離:主要使用RP-HPLC分離酶解肽段。
- 檢測與鑒定:聯(lián)用UV檢測器和質(zhì)譜檢測器(LC-UV-MS/MS)。通過比較樣品肽圖與理論(或?qū)φ掌罚╇膱D的保留時間、質(zhì)荷比(m/z)以及肽段碎片質(zhì)譜圖(MS/MS),進(jìn)行定性和定量比較。
- 完整序列確認(rèn): 綜合運(yùn)用肽圖分析(Bottom-up)、Top-down質(zhì)譜(直接碎裂完整分子)和/或從頭測序軟件分析MS/MS數(shù)據(jù)來完成。
- 二硫鍵定位:
- 非還原肽圖法:在非還原條件下進(jìn)行酶解和LC-MS/MS分析,直接鑒定含二硫鍵連接的肽段。
- 還原烷基化對比法:比較還原烷基化前后肽圖的差異,通過消失的峰(二硫鍵連接肽)和出現(xiàn)的峰(游離肽)定位。
- 使用特異性斷裂二硫鍵的化學(xué)試劑或酶(如TCEP還原劑),結(jié)合質(zhì)譜分析。
- 游離巰基分析: 常用Ellman's試劑(DTNB)比色法或質(zhì)譜結(jié)合烷基化試劑標(biāo)記法。
檢測標(biāo)準(zhǔn)
一級結(jié)構(gòu)表征需要遵循嚴(yán)格的法規(guī)和行業(yè)標(biāo)準(zhǔn),以確保結(jié)果的可靠性、準(zhǔn)確性和可比性:
- 國際人用藥品注冊技術(shù)協(xié)調(diào)會 (ICH):
- ICH Q6B: 生物技術(shù)產(chǎn)品及生物制品的測試方法和可接受標(biāo)準(zhǔn) - 明確要求對生物技術(shù)產(chǎn)品和生物制品的一級結(jié)構(gòu)進(jìn)行詳細(xì)表征,包括分子量、肽圖、N-末端序列等。
- 各國藥典:
- 美國藥典 (USP): 包含多個相關(guān)通則和方法,如:
- `<1052>` 生物技術(shù)衍生品——蛋白質(zhì)和多肽的鑒別與表征
- `<1084>` 糖蛋白的鑒定
- `<1217>` 治療性蛋白的肽圖分析
- `<1058>` 分析儀器確認(rèn)
- 歐洲藥典 (EP): 在多個專論和通則(如2.2.56 氨基酸分析, 2.2.43 質(zhì)譜, 專論中具體要求)中規(guī)定了一級結(jié)構(gòu)測試要求。
- 中國藥典 (ChP): 在三部生物制品相關(guān)章節(jié)和通則(如 0401 質(zhì)譜法, 0431 肽圖檢查法, 3125 氨基酸分析, 3126 N端氨基酸序列分析)中提供了詳細(xì)的方法和要求。
- 行業(yè)指南與最佳實(shí)踐:
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CMA認(rèn)證
檢驗檢測機(jī)構(gòu)資質(zhì)認(rèn)定證書
證書編號:241520345370
有效期至:2030年4月15日
CNAS認(rèn)可
實(shí)驗室認(rèn)可證書
證書編號:CNAS L22006
有效期至:2030年12月1日
ISO認(rèn)證
質(zhì)量管理體系認(rèn)證證書
證書編號:ISO9001-2024001
有效期至:2027年12月31日